これまでjQueryを用いたcheckboxのcheck/uncheckは下記のようにしていました。

checkbox.attr(‘checked’, ‘checked’)

checkbox.removeAttr(‘checked’)

しかし、どういうわけかコレが効かなくなる場合がありました。

同様にハマッているひとがいまして、こちらの記事で無事に解決させていただきました。
http://stackoverflow.com/questions/14769408/jquery-checkbox-check-uncheck

checkbox.prop(‘checked’, true)

checkbox.prop(‘checked’, false)

確かにこちらの方がしっくり来ます。ちなみにcheckboxがcheckであるかどうかは

checkbox.attr(‘checked’) == ‘checked’　でなく

checkbox.is(‘:checked’)　とするのが良いようです。

jQuery1.6あたりでそれまでattrがattrとpropに分かれたようです。
その辺の情報は下記のリンクまで。

http://myjquery.blog.fc2.com/blog-entry-14.html#modified-10